Ngày 27 tháng 9 năm 2016, trong một bài phát biểu trước công chúng tại Quần đảo Thousand, Basuki lưu ý việc một số công dân sẽ không bỏ phiếu cho ông vì họ đang bị "lừa dối bằng cách sử dụng câu 51 của Al Maidah và những điều khác..."[25] Một số tổ chức đã trích dẫn lại câu nó này để chống lại ông.[26] Chính quyền Jakarta đã tải bản ghi hình lên YouTube trên kênh thường xuyên mô tả các hoạt động của Basuki.[27] Một số nhóm đã chỉ trích tuyên bố của Basuki, họ coi đó là một sự xúc phạm với Kinh Koran.[25] Video này đã khiến ông bị chỉ trích rộng rãi trên các phương tiện truyền thông xã hội như Facebook và Twitter.[27] Một bản kiến ​​nghị tại change.org chỉ trích ông đã nhận được hàng chục ngàn chữ ký.[27]

Một số tổ chức, bao gồm Mặt trận Bảo vệ Hồi giáo (FPI) và một hội địa phương của Hội đồng Ulema Indonesia, đã báo cáo vụ việc của Basuki với cảnh sát. Họ buộc tội ông đã vi phạm Luật lạm dụng và xúc phạm tôn giáo của Inđônêxia (Indonesia's Law On Misuse and Insult of Religion)[28] Basuki tiến hành đính chính nói rõ vụ việc, đồng thời xin lỗi vào ngày 10 tháng 10 năm 2016. Basuki cho rằng, những phát biểu của ông không nhằm mục đích diễn giải kinh Koran, mà đơn thuần chỉ đề cập tới việc một số chính khách “đã diễn giải sai lệch lời kinh Koran do họ không muốn phải cạnh tranh một cách công bằng với ông trong cuộc bầu cử”.[6] Các cáo buộc về ông không bị thu hồi và cảnh sát tiến hành điều tra về các cáo buộc đối với ông.

Ngày 13 tháng 12 năm 2016, tại tòa án Indonesia, hội đồng gồm năm thẩm phán đã bác bỏ lập luận của các luật sư bảo vệ cho Basuki khi họ yêu cầu bãi bỏ bản cáo trạng vì nó thiếu chính xác. Ông có thể bị kết án 5 năm tù nếu bị tòa án xét là có tội.[6]